雪茄工廠制作雪茄在把雪茄裝進盒子后，工廠環節也就完成了，雪茄進入了流通環節。通常工廠內并不會醇化整盒的雪茄，雪茄金庫內儲存醇化的都是還沒有裝盒的雪茄。很多人會認為雪茄卷制完成后直接裝盒，其實不是，雪茄在裝盒前的最后一步實際上是分類。

很多雪茄工廠專門有一個人給卷制好的雪茄做分類，一張巨大的桌面上擺滿了雪茄，這些雪茄都是同一批次當天卷制出來的同一型號雪茄。

每個工人卷完雪茄之后會把卷好的雪茄放在一個長方形的盒子里，分類工人會把這些雪茄全都倒到桌面上，然后根據不同顏色把雪茄歸類，一個批次的雪茄存在肉眼可見的顏色差異，有些顏色差別還很大，這些雪茄可能能分成十幾個類別。之所以要做這樣的分類，是要確保一個盒子里面的雪茄在顏色上近似一致。

所以一個盒子里面的雪茄顏色一般都會近似一致，可能同一年份、同一品牌、同一型號，不同盒的雪茄可能有很大差異。如果你在不同地區購買同一個年份的同一型號雪茄，就能看出來明顯的顏色差異，通常不少歐洲地區的古巴雪茄會比亞洲地區的顏色深一點。

不過永遠不會有相同的雪茄。手工雪茄作為純自然煙葉的產物，無論從煙葉本身還是工人手藝，絕對無法保障同一個型號的雪茄百分百一致。世界上沒有兩片完全相同的葉子，也就不可能存在兩支完全相同的雪茄。

分類后裝盒的雪茄在顏色上近似一致，不過時間又會破壞這種秩序。

裝盒后的成品雪茄也會發生顏色變化，成品雪茄在養護的過程中顏色變色，一般認為有兩種類型的機制在煙葉深色化反應中起主要作用。一個是羥基反應，它是一個復雜而相當難解的連續化學反應，反應的中間階段產生的香味物質，對煙葉香氣的產生起著重要的作用。另一個是焦糖化反應，即糖類加熱出現焦糖化，經過一系列反應，生成呋喃類香味物質，產生具有奶油物質香味，在外觀上反映出葉色變深。同樣一盒雪茄里面的雪茄變化進程不同，也就產生了顏色差異。