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普通煙草DREB轉錄因子的序列鑒定表達研究獲進展

2017年03月09日 來源:云南煙葉信息網(wǎng) 作者:
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  煙草在線據(jù)云南煙葉信息網(wǎng)報道  DREB轉錄因子的AP2/ERF結構域,對植物抗逆起關鍵作用。“普通煙草DREB轉錄因子的序列鑒定與表達分析”揭示,普通煙草基因組編碼68個DREB轉錄因子家族成員,大部分DREB家族基因在煙草中低量表達,但在逆境脅迫下基因表達量上調。該成果2月28日發(fā)表在《中國煙草科學》2017年第1期上。

  該研究利用生物信息學分析手段,以擬南芥DREB家族成員序列為參照,在普通煙草(Nicotiana tabacum)基因組公共數(shù)據(jù)庫中鑒定出了68個DREB轉錄因子。對煙草DREB轉錄因子家族進行了理化性質、系統(tǒng)進化、保守結構域和表達分析。

  該研究表明,普通煙草基因組編碼68個DREB轉錄因子家族成員,氨基酸數(shù)目差異較大;系統(tǒng)發(fā)育分析表明,擬南芥和煙草的DREB轉錄因子共125個成員形成6個進化分支,其中煙草比擬南芥缺少A6分支;結構域分析表明,同一分支內的DREB轉錄因子的保守結構域以及motif具有高度的一致性;組織表達分析表明,大多數(shù)DREB家族基因在煙草中表達量較低,在衰老、干旱和病害脅迫下基因表達量較多。此研究將為煙草DREB轉錄因子的深入分析奠定了生物信息學基礎。

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