煙草在線據(jù)云南煙葉信息網(wǎng)報(bào)道 云南省煙草農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院與云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)與種質(zhì)資源研究所合作完成的“云南煙草中煙草花葉病毒株系比較與分析”研究發(fā)現(xiàn),云南煙草花葉病樣分離物均屬于TMV-U1株系,各地的煙草TMV外殼蛋白在空間結(jié)構(gòu)上一致,認(rèn)為可通過制備一個(gè)分離物的特異性抗體用于不同區(qū)域病毒的檢測。該結(jié)果發(fā)表在《中國煙草學(xué)報(bào)》2013年第6期上。
煙草花葉病毒(TMV)是煙草花葉病毒屬的代表種,該病毒具有較廣的寄主范圍,可侵染包括30個(gè)科的310多種植物。TMV基因組全長6395nt,為單鏈正義RNA,基因組共編碼4個(gè)ORF,其中外殼蛋白基因(CP)是病毒分類相關(guān)基因。在不同的寄主上TMV有許多株系,在我國主要有TMV-U1、TMV-U2、番茄株系、車前草株系、豆類株系、葫蘆科株系和蘭花株系;煙草上的株系主要有TMV-OM、TMV-U1、TMV-Vulgare、TMVRS、TMVC、TMVN、TMVY。煙草花葉病主要通過汁液傳播,近年來,由于煙葉生產(chǎn)上廣泛應(yīng)用漂浮育苗技術(shù),加大了機(jī)械傳毒的機(jī)率,由TMV引起的花葉病發(fā)生嚴(yán)重,而對花葉病病毒株系尚不清楚。為此,該項(xiàng)研究通過采集云南煙草種植區(qū)的TMV病樣,對不同地區(qū)的TMV外殼蛋白基因進(jìn)行比較,以為TMV的防控及快速檢測方法的研究提供科學(xué)依據(jù)。
該研究利用TAS-ELISA方法(三抗體夾心酶聯(lián)免疫吸附測定)對采自云南不同煙草種植區(qū)的710份花葉病樣進(jìn)行檢測,結(jié)果有546份樣品與TMV抗體呈陽性應(yīng)。據(jù)此根據(jù)地理分布的差異,選擇了38個(gè)代表性分離物進(jìn)行TMV外殼蛋白基因的IC-RT-PCR擴(kuò)增、克隆和測序,結(jié)果發(fā)現(xiàn),38個(gè)TMV cp基因核苷酸序列相似性在95%~100%之間,其推導(dǎo)的氨基酸序列同源性為97.5%~100%。該研究還發(fā)現(xiàn),云南不同TMV分離物TMV-U1、TMV-福建核苷酸相似性大于90%,系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系也顯示云南不同分離物與TMV-U1株系、TMV福建分離物聚為一支。據(jù)此推斷,云南38個(gè)草分離物均屬于TMV-U1株系。
該研究以38個(gè)分離物在氨基酸序列上的差異將其分成12組;再分別繪制12組蛋白質(zhì)親疏水性序列普發(fā)現(xiàn),12組序列普分成兩類;又分類進(jìn)行蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的同源性建模,結(jié)果顯示,兩類蛋白質(zhì)建模的基本模型均為3kmlK(3.01A),且與模型的同一性分別為97.802% 和98.901%,因此判斷兩類蛋白質(zhì)為同一空間結(jié)構(gòu)的蛋白。研究還發(fā)現(xiàn),云南各地?zé)煵萆蟃MV的外殼蛋白在空間結(jié)構(gòu)上一致,其免疫原特性沒有差異,可通過制備一個(gè)分離物的特異性抗體用于不同區(qū)域病毒的檢測。