圍繞雪茄煙葉及其關聯微生物的科學問題，一直是研究熱點。

一直以來，大量研究關注于微生物與雪茄煙葉發酵質量、風味物質形成的關系。

此外，國內一些研究團隊則長期關注雪茄煙葉及其內生菌抑菌、抗病毒應用。相關研究可能為研發更有效的抑菌、抗病毒天然藥劑提供重要途徑，同時有助于實現雪茄煙葉及其內生菌的多功能應用。

2021年9月，云南煙草研究人員在日本雜環化學研究所出版的HETEROCYCLES期刊發表論文，表明從雪茄煙葉中分離出3種新的和3種已知的喹啉生物堿。抗TMV活性測試顯示，有一種新化合物在濃度為42 μM時表現出較高的抗TMV活性，抑制率為2.20%，高于陽性對照（濃度為32 μM時抑制率為5.20%）。其余5種化合物在濃度為28 μM時也顯示出潛在的抗TMV活性，抑制率分別為2.31%、0.22%、8.26%、6.29 %和5.20 %，抑制率略低于陽性對照。

2023年6月，云南煙草研究人員在歐洲植物化學學會出版的植物化學快報發表論文，表明從雪茄煙葉內生菌貓曲霉(Aspergillus felis)培育液中提取分離出3種新的和4種已知異喹啉生物堿，其中有兩種化合物對TMV抑制率高于對照寧南霉素10個百分點和5.2個百分點。

2023年7月，云南煙草研究人員在俄羅斯期刊英譯本天然化合物化學發表論文，表明從雪茄煙葉內生菌曲霉中分離出2種新的以及5種已知的色酮生物堿。抗TMV活性測試顯示，其中三種化合物表現出較高的抗TMV活性，抑制率分別為44.2%、38.5%和40.2%，高于陽性對照。另外三種化合物也顯示出潛在的抗 TMV 活性，抑制率分別在 28.4-31.8% 之間。

2023年8月，云南煙草研究人員在俄羅斯期刊英譯本天然化合物化學發表論文，表明從雪茄煙葉中分離出兩種新的芳香族倍半萜烯，(1-異丙基-6-甲氧基-3-甲基萘-7-基)甲醇和1-異丙基-6-甲氧基-3,7-二甲基萘，以及五種已知的倍半萜。抗真菌活性試驗顯示，兩種新的芳香族倍半萜烯化合物顯示出潛在的抗煙草白粉病主要病原菌Golovinomyces cichoracearum活性，參比陰性對照抑制率分別為55.4% ± 4.8和76.2% ± 5.1，但低于陽性對照的90.5% ± 5.3。

2023年10月，云南煙草研究人員在俄羅斯期刊英譯本天然化合物化學發表論文，表明從雪茄煙草內生菌紅紫曲霉中分離出2種新的以及5種已知的異喹啉。評價了新化合物對丁香假單胞菌（煙草角葉斑病的主要致病菌）的抑菌活性，兩種化合物最低抑菌濃度（MIC50）分別為 8.5 和 5.4 μg/mL，其抑菌效果低于陽性對照（農用鏈霉素2.2μg/mL）。

2023年11月，云南煙草研究人員在俄羅斯期刊英譯本天然化合物化學發表論文，表明從雪茄煙葉內生菌貓曲霉(Aspergillus felis)分離出兩種新的吲哚生物堿felisindoles A、B。抗真菌活性測定顯示，兩種化合物有潛在的抗Golovinomyces cichoracearum(煙草白粉病的主要病原體)活性，參比陰性對照抑制率分別為 72.6% ± 5.2和61.7% ± 5.0，但低于陽性對照的93.2% ± 5.5。

綜上所述，雪茄煙葉及其內生菌，在抑菌、抗病毒等方面表現出一定功效或潛在能力，具有進一步系統研究和應用驗證的必要。