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開啟煙草分子育種新時代

專訪煙草基因組計劃重大專項首席科學家
2014年07月29日 來源:煙草在線東方煙草報報道 作者:黃德磊、張百厚
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  煙草在線東方煙草報報道  首次繪制完成了全套煙草基因組圖譜、制作了全球第一套煙草全基因組基因芯片、突破了多個煙草重要抗病基因、建立了系統的煙草基因組生物信息學數據庫……

  自2010年12月行業啟動煙草基因組計劃重大專項以來,該重大專項取得了累累碩果,使我國一躍成為煙草基因組研究的全球領先者。

  經過四年的探索和實施,煙草基因組計劃重大專項目前處于哪個階段?下一步研究的方向是什么?對我國煙草行業未來的發展將產生何種影響?6月16日,記者就這些問題采訪了煙草基因組計劃重大專項首席科學家。

  從管理運作模式到技術創新成果,煙草基因組計劃將惠及行業內外眾多領域

  采訪伊始,首席科學家為記者通俗地介紹了基因組學的三個層級。

  結構基因組學,就是通過基因測序、組裝等技術工序,繪制出基因圖譜,明確基因是什么、有哪些;功能基因組學,則主要回答基因功能的問題,明確基因干什么、有何用;以功能基因為基礎的品種改良與培育是第三個層級,也是最高層級,通過探尋基因原理,闡明研究基因之間的聯系,利用基因,設計基因,將基因研究成果轉化為產業應用。

  這三個層級共同搭建起一個龐大的研發框架。因其復雜程度遠非行業科研隊伍所能獨立承擔,引入專業科研團隊就成為必然。

  在重大專項的頂層設計中,首席科學家主要負責重大專項研究方向的確定、研究目標的制定、研究任務的規劃部署,同時調配和整合各領域技術力量,統籌協調重大專項內信息、資源、材料、技術等的共享和交流等。

  按照實施方案,“優質超級煙草品種”被確立為重大專項的終極目標。

  “這個新品種依托基因技術誕生,在綠色生態、抗病抗逆、減害等方面具有很大優勢,對推動煙葉產業轉型升級具有重要意義。”首席科學家說。

  此外,重大專項在提升煙草科研技術水平、培養新一代科研力量等方面也將發揮重要作用。

  首席科學家認為,除了對行業自身的意義,重大專項的科學成果還將惠及更多領域。

  他說,實施煙草基因組計劃重大專項,能有效推動重要茄科作物的功能基因研究,提高其品質、產量、抗性及食品安全性,并為其他多倍體作物的基因組計劃實施提供科學借鑒,“這是煙草行業對全社會和作物科學的貢獻”。

  2013年年底,煙草行業繪制完成了全球第一套煙草基因組圖譜,主要包括栽培煙草、林煙草、絨毛狀煙草3個煙草物種的基因組序列圖譜和物理圖譜。全套圖譜的完成,使我國成為國際上率先掌控煙草核心基因信息資源的國家。

  三年時間發布全套煙草基因組圖譜,這在以前是不可能完成的“奇跡”。“舉行業之力、成熟的運作機制、技術團隊的努力,為研發提速、成果出籠提供了更多可能。”首席科學家說。

  發現、研究并利用基因,煙草基因組計劃的最終指向將是煙草分子育種

  煙草基因組巨大,大概4.5GB,約為人類基因組的1.5倍,是最復雜最難以開展研究的植物基因組之一。研究煙草基因組,需要縝密的頂層設計,在平臺搭建、專家配備、制度建設等層面系統布局,全面攻堅,重點突破。

  “總體來說,要先攻克抗病、抗逆等研究基礎較好的性狀,再攻堅煙葉香氣、減害等復雜性狀。”首席科學家說。

  全面攻堅。第一步,舉全行業之力、系統推進煙草全基因組圖譜繪制工作,全面掌控煙草基因組核心數據資源;第二步,發揮各單位科研優勢,依托國家煙草基因研究中心、國家煙草基因工程研究中心等技術平臺,全面布局煙草抗病、抗逆、品質、減害等功能基因組研究和品種改良培育。

  重點突破。目前,在煙草全套基因組圖譜繪制完成的基礎上,集中突破重大專項生物信息學研究、表達譜研究、突變體庫建設、抗病基因定位與品種改良、基因編輯等基因組關鍵技術;國家煙草基因研究中心、國家煙草基因工程研究中心2個中心和信息學、芯片學、基因克隆定位、功能基因研究、基因組重測序、突變體研究、代謝組學7個平臺的研究格局全面形成。

  首席科學家說,集中優勢資源,整理分析這些重大成果和復雜數據,是當前正在穩步推進的重要工作。在此基礎上,下一步將協助各科研團隊發表一批國際領先的高水平成果。

  談到國際領先,首席科學家強調了兩個關鍵問題:一是增強技術自信,二是加強國際合作。

  他指出,前些年,國外煙草公司搞過煙草基因組研究,開展了烤煙、白肋煙、香料煙三個栽培品種和林煙草、絨毛狀煙草兩個野生品種的基因研究,也發表了相關成果。

  “但從成果數據看,他們這個測序質量不高,跟我國煙草行業的成果不在一個層級上。”首席科學家說,煙草行業要增強技術自信,因為目前取得的成果已處于絕對領先地位。

  當然,強調技術自信并非排斥國際合作。首席科學家說,在一些基因項目研究上,行業基因組研究科研單位與國外科研單位建立了合作關系,并為重大專項實施做出了一定貢獻。

  “首先,如果引入國際合作,一定要選擇頂尖專家;其次,自己有能力做的,絕不依靠外力,爭取掌握核心技術。”首席科學家強調。

  關于煙草基因組計劃的最終指向,首席科學家也簡要清晰地予以解答——

  一個是科學命題,在煙草物種起源進化、煙草物質代謝的基本規律、煙草抗病機制等層面取得成果;一個是關鍵應用,著力開展經濟性狀基因的改良研究,利用分子育種技術,培育抗病抗逆品種、低煙堿轉化品種、高香氣品種等。

  這一指向與煙草基因組計劃重大專項所堅持的“發現基因、研究基因、利用基因”十二字方針正相吻合。

  “發現、研究基因,最終是為了利用基因。”首席科學家說,比如在品種改良方面,目前技術團隊在紅花大金元抗病基因研究上已經取得突破。

  首席科學家說,紅花大金元雖然煙葉質量高,但種植難度高,易感黑脛病,如果用傳統方式選育抗病新品種,不但周期長,而且難以達到目標。而借助基因技術,可快速培育出具有抗病能力的紅花大金元新品種,問題迎刃而解。

  首席科學家說,這就是分子育種的魅力,也是煙草基因組技術的終極目標。

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