N6-甲基腺苷(m6A)是真核生物mRNA上最為豐富的一種化學修飾,參與多種重要的生命活動,但目前對模式植物煙草中m6A調控基因的系統性研究尚未見報道。近日,中國煙草總公司鄭州煙草研究院對煙草中可能參與m6A修飾的調控基因進行了全基因組系統分析,探究了煙草m6A調控基因中參與生長發育和逆境脅迫響應的潛在靶標。相關研究論文“Genome-wide identification of the N6-methyladenosine regulatory genes reveals NtFIP37B increases drought resistance of tobacco?(Nicotiana tabacum L.)”近期在植物學國際學術期刊《BMC Plant Biology》(中科院二區,影響因子5.3)在線發表,國家煙草基因研究中心研究生蘇歡為論文第一作者,金靜靜博士為論文通訊作者。
基于栽培煙草基因組序列信息,該研究鑒定出52個候選m6A調控基因,包括16個writer基因、16個eraser基因及20個reader基因,分布于10條染色體上。系統進化分析可將煙草m6A調控基因分為多個亞組,基因結構、保守結構域和基序分析顯示不同亞組的煙草m6A調控基因之間存在結構和功能多樣性。煙草m6A調控基因的擴增主要受到多倍體化和分散復制的驅動,而重復基因則通過純化選擇進化。基于潛在的調控網絡和m6A調控基因表達模式分析,發現大量m6A調控基因可能在生長、發育和應對脅迫過程中發揮重要作用。
圖 煙草中潛在的m6A調控網絡。(a)煙草中m6A調控蛋白的相互作用網絡;(b)NtMTA1-NtMTB3和NtVIR2-NtFIP37A-NtFIP37B蛋白復合物的對接結果;(c)m6A調控基因與miRNA之間的潛在相互作用。
此外,通過組織表達模式、生物/非生物脅迫響應等分析,在煙草中篩選到一個名為NtFIP37B的m6A?writer基因顯著響應煙草干旱脅迫,進一步通過亞細胞定位、VIGS技術初步驗證了該基因在干旱脅迫響應中的功能。
該研究為更好地理解m6A調控基因的演化以及m6A修飾在煙草應對環境脅迫中的作用提供了參考信息。該研究得到了中國煙草總公司重大科技項目、河南省自然科學基金項目、北京生命科技研究院自立項目的支持。
篤行致遠 2024中國煙草行業發展觀察