煙草在線據(jù)國家局網(wǎng)站報道 煙草全基因組基因芯片(Tiling)目前由中國煙草制作完成。該芯片是全球第一套基于全基因組水平的高密度表達譜芯片,是現(xiàn)有煙草基因芯片中探針密度最高、覆蓋基因數(shù)最多的一款芯片。這是在絨毛狀煙草和林煙草全基因組序列精細圖譜繪制完成基礎(chǔ)上,我國煙草基因組計劃重大專項取得的又一項重要的標(biāo)志性成果。
發(fā)現(xiàn)基因、研究基因、利用基因是煙草基因組計劃重大專項的主要任務(wù)。而作為一種高通量分析全基因組基因表達譜的工具,基因芯片可研究煙草不同生長發(fā)育時期的組織和器官的基因表達模式,進而鑒定出與煙草生長、發(fā)育、抗性、品質(zhì)等關(guān)鍵性狀相關(guān)的關(guān)鍵基因,是發(fā)現(xiàn)基因、研究基因的重要手段之一。煙草全基因組基因芯片(Tiling)作為一種精心設(shè)計的新芯片類型,不僅能夠完成上述任務(wù),還能夠有效區(qū)分栽培煙草中來源于祖先種野生煙草父母本同源基因的表達差異,為煙草基因進化演變提供更多數(shù)據(jù)支持,更好的研究和理解基因的效用機制和調(diào)控網(wǎng)絡(luò),為分子育種提供技術(shù)支撐。
煙草全基因組基因芯片是我國煙草基因組計劃重大專項表達譜項目研究團隊同美國Affymetrix公司聯(lián)合攻關(guān)的成果,在充分利用現(xiàn)有的煙草全基因組序列精細圖譜研究成果的基礎(chǔ)上,以融合疊瓦式(Tile path)設(shè)計理念研制而成。該款芯片覆蓋了36728個林煙草和絨毛狀煙草高度同源基因、38406個林煙草和絨毛狀煙草非高度同源基因、18966個栽培煙草基因,煙草基因探針集總數(shù)為2190855個,基因覆蓋度和芯片質(zhì)量均居國際領(lǐng)先水平。