煙草在線據(jù)云南煙葉信息網(wǎng)報(bào)道 野火病是煙草上的主要葉斑類病害,大部分病原菌的毒素、細(xì)胞壁降解酶等致病因子為分泌蛋白,信號肽在分泌蛋白跨膜、轉(zhuǎn)運(yùn)及識別植物受體蛋白過程中起著非常重要的作用。信號肽一般由10-40個(gè)氨基酸殘基組成,通常大致分為3個(gè)區(qū)段:其中,N端為堿性氨基末端,通常由帶正電荷的氨基酸組成;中間,為疏水中心,主要由20個(gè)或以上的中性氨基酸組成;C端,為加工區(qū),含有被信號肽酶裂解的部位,其中小分子氨基酸如甘氨酸、丙氨酸、絲氨酸較多。
發(fā)表在2016年第1期《中國煙草學(xué)報(bào)》上的“煙草野火病菌Pseudomonas syringae pv. tabaci yuexi-1信號肽預(yù)測及分析”研究,利用SignalP 4.0、LipoP1.0及TMHMMv2.0,對分離自四川越西縣煙草病樣上的一株致病力很強(qiáng)的煙草野火病菌株P(guān)seudomonas syringae pv. tabaci yuexi-1菌株基因組中信號肽的數(shù)量、長度和氨基酸組成進(jìn)行了預(yù)測分類,確定其中432個(gè)ORFs (Open reading frame)所編碼的N端有信號肽序列,占全部ORFs的8.81%。其中351條分泌型信號肽(SPI),81條脂蛋白型信號肽(SPII)。在分泌型信號肽中,信號肽的長度為11-42個(gè)氨基酸,以長度為22個(gè)氨基酸的信號肽最多。同源性分析結(jié)果顯示,具有相同信號肽序列的不同蛋白序列之間高度保守。
該研究提供了野火病原菌致病因子的備選基因,提高了對該病菌致病因子的篩選效率。
篤行致遠(yuǎn) 2024中國煙草行業(yè)發(fā)展觀察